Study Uncovers Biomarkers Linked to Chemotherapy Response in NSCLC Patients Carrying EGFR Variants
SAN DIEGO--(BUSINESS WIRE)--Cellworks Group Inc., a leader in Personalized Therapy Decision Support and Precision Drug Development, today announced findings from a study using the Cellworks Platform to predict the benefits of adding chemotherapy to osimertinib treatment in patients with EGFR mutated non-small cell lung cancer (NSCLC). Leveraging data from a real-world retrospective cohort, the biosimulation study confirmed that adding chemotherapy to osimertinib led to a higher predicted overall response rate (ORR). The study revealed that while all patients responded to the addition of chemotherapy, the magnitude of benefit varied among individuals and was intricately determined by underlying genomic abnormalities, enabling the identification of patients who would benefit from combination therapies, and others who would achieve similar outcomes without the addition of chemotherapy.
Results from the study were showcased in a poster presentation (P1.06A.03) titled 'Use of Biosimulation to Predict Concomitant Chemotherapy Benefit in NSCLC Patients with EGFR Mutations Being Treated with Osimertinib' as part of the IASLC 2024 World Conference on Lung Cancer hosted by the International Association for the Study of Lung Cancer in San Diego, California on September 8, 2024.
"Osimertinib has become a standard treatment option in patients with NSCLC harboring EGFR mutations," said Dr. Charu Aggarwal, MD, MPH, Professor of Medicine, University of Pennsylvania, Associate Director, PC3I and Director, Program in Precision Oncology Innovation, Penn Center for Cancer Care Innovation; and Principal Investigator for the study. "However, while targeted therapies are generally effective for these patients, response rates can vary significantly, and the potential advantage of incorporating chemotherapy in some patients remains unclear. This study demonstrates how utilizing Cellworks biosimulation can provide valuable insights by more accurately predicting the benefit of chemotherapy, as it allows for a deeper understanding of an individual patient's therapy response based on biosimulation of their full mutation profile."
"This study opens new potential avenues for optimizing treatment strategies in NSCLC patients with EGFR mutations," said Dr. Michael Castro, Cellworks Chief Medical Officer. "By identifying additional biomarkers that influence chemotherapy response in NSCLC patients, we gain a deeper understanding of how each patient's unique disease profile impacts therapy effectiveness. EGFR blockade can reverse chemotherapy resistance for some patients by downregulating apoptotic blockade and DNA repair caused by EGFR. Through the use of Cellworks personalized therapy biosimulation, we can pave the way for individualized decision making to determine which patients should be offered combination therapy upfront, thereby improving survival outcomes."
Study Design
Cellworks computational biosimulation was performed in this study to evaluate the additive value of chemotherapy in patients with advanced non-small cell lung cancer (NSCLC) with EGFR mutations. A real-world retrospective cohort of 116 frontline NSCLC patients treated with osimertinib were obtained from the nationwide (US based) de-identified Flatiron Health-Foundation Medicine NSCLC clinico-genomic database (FH-FMI-CGDB). Biosimulated efficacy scores were generated for both osimertinib alone and in combination with carboplatin and pemetrexed. The study then analyzed chemotherapy-driven improvements in predicted clinical response, using the upper 95% confidence interval of the osimertinib ES as a threshold.
Study Results
The efficacy scores for osimertinib were significantly associated with clinical outcomes, confirming the predictive power of Cellworks computational biosimulation. Importantly, the biosimulated addition of chemotherapy to osimertinib led to a higher efficacy score for some patients, allowing for a more refined selection of patients, moving beyond the generalized conclusion that chemotherapy is beneficial in combination, which may apply to some, but not all, patients. The benefit of chemotherapy is unevenly distributed in the population, and biosimulation aids in the selection of which patients are most likely to get a benefit from combination compared to sequential treatment.
The Cellworks Platform
The Cellworks Platform biosimulates the impact of specific drug compounds on an individual patient or class of patients using their multi-omic profile. Multi-omic data from an individual patient or cohort is used as input to the in silico Cellworks Computational Biology Model (CBM) to generate a personalized or cohort-specific disease model. The CBM is a highly curated mechanistic network of 6,000+ human genes, 30,000 molecular species and 600,000 molecular interactions. This model along with associated drug models are used to biosimulate the impact of specific compounds or combinations of drugs on the patient or cohort and produce therapy response predictions, which are statistically modeled to produce a qualitative Therapy Response Index (TRI) score, scaled from 0 (unfavorable outcome) to 100 (favorable outcome) for a specific therapy. The Cellworks CBM has been tested and applied against various clinical datasets with results provided in over 125 presentations and publications with global collaborators.
About Cellworks Group
Cellworks Group, Inc. is a leader in Personalized Therapy Decision Support and Precision Drug Development. The Cellworks Platform predicts therapy response for individual patients and patient cohorts using a breakthrough Computational Biology Model (CBM) and biosimulation technology. Backed by Artiman Ventures, Bering Capital, Sequoia Capital, UnitedHealth Group and Agilent Ventures, Cellworks has the world's strongest trans-disciplinary team of molecular biologists, cellular pathway modelers and software engineers working toward a common goal – attacking serious diseases to improve the lives of patients. The company is based in South San Francisco, California with a CLIA-certified computational laboratory in Franklin, Tennessee and a research and development facility in Bangalore, India. For more information, visit .
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EGFR変異体を保有するNSCLC患者における化学療法の反応に関連するバイオマーカーが解明された研究を行いました
Cellworksグループは、個別化療法の意思決定サポートと精密薬物開発のリーダー企業として、EGFR変異性非小細胞肺癌(NSCLC)患者のオシメルチニブ治療に化学療法を加える利益を予測するためのCellworksプラットフォームを使用した研究の結果を発表しました。実世界の後ろ向きコホートからのデータを活用したバイオシミュレーション研究では、オシメルチニブに化学療法を加えることで予測された全体的な応答率(ORR)が増加することが確認されました。研究は、すべての患者が化学療法の追加に反応したことを明らかにしましたが、利益の程度は個人によって異なり、基底の遺伝子異常によって複雑に決定されます。これにより、組み合わせ療法の利益を受ける患者と、化学療法の追加なしで同様の結果を得る患者の同定が可能となりました。
この研究の結果は、2024年9月8日にカリフォルニア州サンディエゴで開催された国際肺癌研究協会主催のIASLC2024World Conference on Lung Cancerのポスター発表(P1.06A.03)"Use of Biosimulation to Predict Concomitant Chemotherapy Benefit in NSCLC Patients with EGFR Mutations Being Treated with Osimertinib"で紹介されました。
「EGFR変異体を保有するNSCLC患者におけるオシメルチニブは標準的な治療オプションになっています」と、研究の主担当者であるPennsylvania大学医学部のCharu Aggarwal博士(内科教授、PC3I副所長、Program in Precision Oncology Innovationディレクター、Penn Center for Cancer Care Innovationディレクター)は述べています。「しかし、標的療法は一般的にこれらの患者に対して効果的ですが、応答率は大きく異なることがあり、化学療法を組み込むことの潜在的な利点は不明です。この研究は、Cellworksのバイオシミュレーションを活用することで化学療法の利益をより正確に予測することができるため、患者の完全な変異プロファイルに基づいた彼らの治療反応のより深い理解を提供することを実証しています。
「この研究は、EGFR変異を持つNSCLC患者の治療戦略を最適化するための新しい可能性の道を開く」と、CellworksのチーフメディカルオフィサーであるMichael Castro博士は述べています。「NSCLC患者における化学療法反応に影響を与える追加のバイオマーカーを特定することで、各患者の独自の病態プロファイルが治療効果にどのような影響を与えるかをより深く理解することができます。EGFRによって引き起こされるアポトーシス阻害とDNA修復が下がることで、EGFRブロックは化学療法抵抗性を逆転させることができます。Cellworksの個別化療法バイオシミュレーションの使用により、どの患者に最初からの併用療法が提供されるべきかを判断するための個別化した意思決定の道を開くことができ、これにより生存率が改善されます。」
研究デザイン
この研究では、EGFR変異を持つ進行性非小細胞肺がん(NSCLC)患者における化学療法の付加価値を評価するために、Cellworksの計算機シミュレーションが行われました。FH-FMI-CGDBから得られた116人のNSCLC患者の実世界の後ろ向きコホート(osimertinibで治療されたフロントラインのNSCLC患者)が利用されました。バイオシミュレーションによる効果スコアは、osimertinib単独とカルボプラチン・ペメトレキセドとの併用の両方について生成されました。研究では、上位95%信頼区間のosimertinib ESを閾値として、化学療法による予測される臨床反応の改善を分析しました。
調査結果
osimertinibの有効性スコアは臨床結果と有意に関連しており、Cellworksの計算機シミュレーションの予測能力を確認しています。重要なことは、osimertinibに化学療法を追加するバイオシミュレーションにより、一部の患者の有効性スコアが高くなり、化学療法が併用時に有益であるという一般的な結論を超えた、患者のより洗練された選択が可能となります。化学療法の利益は人口内で均等に分布しておらず、バイオシミュレーションは、シーケンシャル治療と比較して併用療法から利益を得られる可能性が最も高い患者の選択を支援します。
セルワークスプラットフォーム
セルワークスプラットフォームは、個別の患者または患者のクラスにおける特定の薬物化合物の影響を彼らの多次元プロファイルを使用してバイオシミュレーションします。個別の患者またはコホートからの多次元データは、in silicoセルワークス計算生物学モデル(CBM)の入力として使用され、個別のまたはコホート固有の疾患モデルを生成します。CBMは、6,000以上の人間の遺伝子、30,000の分子種、600,000の分子相互作用からなる、非常にキュレーションされた機械的ネットワークです。このモデルと関連する薬物モデルは、特定の化合物または薬物の組み合わせが患者またはコホートに与える影響をバイオシミュレーションし、治療反応の予測を生成します。この予測は統計的にモデル化され、特定の治療に対する定性的な治療反応指標(TRI)スコアを生成します。スコアは0(不利な結果)から100(有利な結果)の範囲でスケールされます。
セルワークスグループについて
Cellworks Group, Inc.は、個別の患者および患者のコホートに対する治療反応を予測するための先進的な計算生物学モデル(CBM)とバイオシミュレーション技術を使用したパーソナライズド療法の意思決定支援と精密な薬物開発のリーダーです。Artiman Ventures、Bering Capital、Sequoia Capital、UnitedHealth Group、Agilent Venturesの支援を受けて、Cellworksは、分子生物学者、細胞経路モデラー、ソフトウェアエンジニアの世界でもっとも強力な横断的チームを擁する企業となり、共通の目標である重篤な疾患に対処し、患者の生活を改善するために取り組んでいます。同社は、サウスサンフランシスコに本社を置き、テネシー州フランクリンにCLIA認定の計算化学ラボ、およびインドのバンガロールに研究開発施設を有しています。詳細は、をご覧ください。
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